闡述pcr核酸檢測試劑盒建立的理論模式和工作原理
1、什么是定量PCR?
以參照物為標(biāo)準(zhǔn),對PCR終產(chǎn)物進(jìn)行分析或?qū)CR過程進(jìn)行監(jiān)測,從而達(dá)到評估樣本中靶基因的拷貝數(shù),稱為定量PCR。定量PCR的可行性定量一般是在PCR擴增的指數(shù)期進(jìn)行的。
2、定量PCR定量的理論依據(jù)是什么?
特定的待擴增基因片段起始含量越大,則指數(shù)擴增過程越短,當(dāng)擴增速率趨于穩(wěn)定后,則無論原來樣品中起始模板含量多少,終擴增片段的含量通常是一樣的。
理想的擴增結(jié)果:Y=X×2n其中Y代表擴增產(chǎn)物量,X代表PCR反應(yīng)體中的原始模板數(shù)n為擴增次數(shù);理論上PCR擴增效率為*,PCR產(chǎn)物隨著循環(huán)的進(jìn)行成指數(shù)增長,但實際上:DNA的每一次復(fù)制都不*,即每一次擴增中,模板不是呈2的倍增長;實際應(yīng)為:Y=X(1+E)n,其中E代表擴增效率:E=參與復(fù)制的模板/總模板,通常E≤1,E在整個PCR擴增過程中不是固定不變的。通常X在1~105拷貝、循環(huán)次數(shù)n≤30時,E相對穩(wěn)定,原始模板以相對固定的指數(shù)形式增加,適合定量分析,這也就是所謂的指數(shù)期;隨著循環(huán)次數(shù)n的增加(>30次),E值逐漸減少,Y呈非固定的指數(shù)形式增加,后進(jìn)入平臺期。
3、熒光定量PCR定量的理論模式又是什么?
PCR是對原始待測模板核酸的一個擴增過程,任何干擾PCR指數(shù)擴增的因素都會影響擴增產(chǎn)物的量,使得PCR擴增終產(chǎn)物的數(shù)量與原始模板數(shù)量之間沒有一個固定的比例關(guān)系,通過檢測擴增終產(chǎn)物很難對原始模板進(jìn)行準(zhǔn)確定量。近年來研究人員通過大量的實踐,研究了相對準(zhǔn)確的定量PCR方法,即熒光定量PCR。
PCR擴增通式:①Tn=T0(1+E)n
?、赥n=Tn-1(1+E)n注:[0
其中E表示擴增效率,n為循環(huán)數(shù),Tn表示在n個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Tn-1表示在n-1個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,T0為原始模板數(shù)量。設(shè)定PCR到達(dá)指數(shù)擴增期時,產(chǎn)生一定的熒光(熒光依賴于某一循環(huán)擴增產(chǎn)物的總量,即特定的拷貝數(shù)K,為常數(shù),大約在1010左右)高于背景為儀器所識別,此時的循環(huán)數(shù)為CP(crossingpoint),也就是K=T0(1+E)CP,取對數(shù)即:
lgK=lgT0+CP*lg(1+E)
CP=-1/lg(1+E)*lgT0+lgk/lg(1+E)
pcr核酸檢測試劑盒的成分產(chǎn)品組成:DNA提取液2、CTPCR反應(yīng)液、HS-Taqplus酶、UNG、CT陰性對照、CT臨界陽性對照、CT強陽性對照。產(chǎn)品有效期:貯存于-20℃,有效期12個月。附件:注冊產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),產(chǎn)品說明書。
適應(yīng)癥該產(chǎn)品用于對人尿道、生zhi道分泌物拭子樣本中的沙眼衣原體核酸DNA的檢測
PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個報告熒光基團(tuán)和一個淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時,報告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;剛開始時,探針結(jié)合在DNA任意一條單鏈上;PCR擴增時,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
pcr核酸檢測試劑盒的檢驗原理:pcr核酸檢測試劑盒從人血清或血漿中提取丙型肝炎病毒核酸(HCVRNA),通過RT-PCR一步法反應(yīng),利用特異性引物對HCVRNA進(jìn)行體外擴增,在體系中采用Taqman-MGB探針法并結(jié)合非競爭性內(nèi)標(biāo)技術(shù)來定量檢測人血清或血漿中丙型肝炎病毒核酸(HCVRNA)的數(shù)量。可用于臨床對丙型肝炎的輔助診斷和抗病毒yao物的療效觀察。