美繪出DNA一修飾因子基因圖譜
美國科學(xué)家已經(jīng)繪制出了人體胚胎干細(xì)胞內(nèi)一個(gè)名為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)的修飾因子的全基因圖譜??茖W(xué)家們表示,5hmC在一些被打開或激活的基因內(nèi)出現(xiàn)的頻率非常高,研究將有助于癌癥的控制。研究論文發(fā)表在一期《基因組生物學(xué)》雜志上。
加州大學(xué)洛杉磯分校生命科學(xué)學(xué)院分子、細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)教授斯蒂芬·雅各布森表示,癌癥通常是由于某些基因(比如腫瘤抑制基因)被不正確地關(guān)閉或發(fā)生了變異,或者一些本來應(yīng)該被關(guān)閉的基因被打開了而引發(fā)的。對(duì)特定基因進(jìn)行調(diào)控會(huì)大大影響癌癥的惡化進(jìn)程,因此,發(fā)現(xiàn)對(duì)癌癥控制非常重要。
zui近才被發(fā)現(xiàn)的5hmC分子由DNA(脫氧核糖核酸)的堿基胞嘧啶添加一個(gè)甲基接著再添加一個(gè)羥基所形成,在胞嘧啶上新形成的這個(gè)羥甲基有潛力打開和關(guān)閉一個(gè)基因,但它身處基因組內(nèi)的何處,目前還不得而知。理解5hmC如何工作以及在何處起作用,科學(xué)家才能更好地理解基因如何關(guān)閉和打開,進(jìn)而出控制基因調(diào)節(jié)的新方法。
人類胚胎干細(xì)胞富含5hmC分子,大腦中也富含5hmC分子。在試驗(yàn)中,雅各布森團(tuán)隊(duì)選擇了人類的胚胎干細(xì)胞,使用基因組學(xué)來確定5hmC出現(xiàn)在人類胚胎干細(xì)胞的何處。
雅各布森在研究中發(fā)現(xiàn),5hmC傾向于出現(xiàn)在被激活的基因中,也出現(xiàn)在一類控制基因表達(dá)、名為增強(qiáng)器的DNA調(diào)節(jié)元件中。這表明,5hmC在激活細(xì)胞方面起關(guān)鍵作用,這同被人們研究得更多的5mC(DNA甲基化)的作用相反,5mC的主要作用是使基因沉默,它們之間的關(guān)系與科學(xué)家們之前認(rèn)為的5hmC直接來源于5mC相吻合。
雅各布森團(tuán)隊(duì)希望接下來揭示5hmC如何通過DNA甲基化被出來以及它如何被限制在基因組中的增強(qiáng)器等特定區(qū)域中。